我院消化科于1965年成立，1984年設立胃鏡室。2012年消化內科與胸外科整合被重慶市衛生局批準為重慶市醫療特色食管疾病專科。同年被重慶市衛生局批準為住院醫生規范化培訓基地，袁曉英主任擔任內科培訓基地主任。2013年被重慶市北碚區批準為重慶市北碚區醫療專科。經過50年的發展，消化內科現已建成一個綜合臨床、內鏡診療技術、科研教學和優質護理的現代化科室，擔負著重慶北部地區的消化系統急危重癥（如消化道大出血、急性重癥胰腺炎、急性化膿性膽管炎和失代償期肝硬化等）的搶救及治療，并全面系統診治食道、胃腸、肝膽、胰腺等相關疾患。科室堅持專科醫療服務，不斷提高專科診治和護理水平，為病人提供專業性個體化治療。病人群體輻射北碚乃至合川、岳池、武勝等周邊地區，樹立了良好口碑和品牌。科室擁有的專科設備有：獨立的內鏡室、潘太克斯胃鏡系統6臺，奧林巴斯色素內鏡（NBI）1臺、腸鏡系統2臺、十二指腸鏡1臺，愛博氬氣治療儀1臺、胃腸鏡消毒系統2套、超低溫冷凍罐1臺、結腸灌洗儀及附屬設備1套、腹水濃縮回收機1臺、B超引導下肝活檢穿刺槍1把。目前開展的主要基礎醫療技術有：無痛胃腸鏡、色素內鏡、膠囊內鏡檢查、胃電圖，抗反流食道賁門支架置入術、鎳鈦記憶合金支架治療食管狹窄術、食道狹窄擴張術、上消化道出血鏡下鈦夾、氬離子凝固止血、食道靜脈曲張套扎術、食道靜脈曲張硬化劑注射術、胃底靜脈曲張粘合劑注射術、痔瘡硬化劑注射治療、Barrett食管氬等離子凝固術、食道及胃腸道息肉摘除術、EMR（內鏡下粘膜切除）、ESD（內鏡下粘膜剝離）、腸道狹窄支架植入術、逆行胰膽管造影（ERCP）和十二指腸乳頭切開取石術、鼻膽管引流術（ENBD）、鼻胰管引流術（ENPD）、膽道支架置入術、消化道異物取出術、三腔二囊管壓迫止血術、頑固性腹水濃縮回輸術、B超引導下（肝囊腫、肝膿腫）穿刺術、B超引導下肝活檢術、C13、C14呼氣實驗測定幽門螺旋桿菌、胃腸功能起搏治療、胃酸測定、食管測壓、胃電圖等。