肝膽胰外科（微創(chuàng)外科）位于住院大樓10樓，擁有普通病床23 張。科室成立于2005年9月，是在原普通外科的基礎(chǔ)上建立起來。目前是深圳市南山區(qū)唯一的具有專科診室及病房的科室，也是深圳市為數(shù)不多的幾家專科之一。年門（急）診量6000余人次；出院病人800人次左右，手術(shù)量600臺(tái)次。科室成立之初，醫(yī)院領(lǐng)導(dǎo)就本著高起點(diǎn)的原則，將科室與被譽(yù)為“醫(yī)院中的黃埔軍校”的西南醫(yī)院肝膽外科合作，將西南醫(yī)院的先進(jìn)技術(shù)引進(jìn)南山醫(yī)院。目前又與久負(fù)盛名的華中科技大學(xué)協(xié)和醫(yī)院合作，得到他們的技術(shù)支持，該院胰腺外科在國(guó)內(nèi)處于領(lǐng)先水平。到目前為止，科室已經(jīng)開展了絕大部分三甲手術(shù)，手術(shù)效果良好，受到患者的好評(píng)。此外，科室還與廣州中山大學(xué)附屬醫(yī)院、南方醫(yī)院、北京301醫(yī)院及四川華西醫(yī)院等有廣泛的業(yè)務(wù)聯(lián)系。肝膽外科的目標(biāo)是立足深圳西部，輻射深圳乃至珠三角，爭(zhēng)取借與協(xié)和醫(yī)院合作的東風(fēng)，以一流的員工素質(zhì)、一流的技術(shù)水平、一流的服務(wù)作風(fēng)創(chuàng)出一流的服務(wù)質(zhì)量，更好地滿足廣大群眾不同層次的醫(yī)療服務(wù)需求。

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