復旦大學附屬眼耳鼻喉科醫院是一所集醫療、教學、科研為一體的三級甲等眼耳鼻喉專科醫院。醫院由國家一級教授胡懋廉、郭秉寬等創辦于1952年，創辦時名為上海醫學院眼耳鼻喉科學院；2001年更為現名。2004年，醫院獲“上海市紅十字眼耳鼻喉科醫院”冠名；2006年，獲第二冠名“上海市五官科醫院”；2020年，“復旦大學附屬眼耳鼻喉科醫院互聯網醫院”正式上線。 醫院設有眼科、耳鼻喉科、眼耳鼻整形外科、放療科、麻醉科、急診科、口腔科、護理八個臨床科室和放射、病理、藥劑、檢驗、營養五個醫技科室。醫院現有汾陽、寶慶、浦江三個院區，統一管理，提供同質化服務。汾陽院區位于上海市徐匯區汾陽路83號，占地33畝；寶慶院區位于上海市徐匯區寶慶路19號，占地2.4畝；浦江院區位于上海市閔行區江月路2600號，占地100畝。醫院核定床位數894張，實際開放床位數733張。2019年總門診量超248萬人次，手術量超14萬人次，醫療輻射全國各地。 截至2020年11月，醫院在職員工1408人，其中中國科學院院士1人，973項目首席科學家1人，長江特聘和講座教授3人，國家杰出青年科學基金項目獲得者3人，國家優秀青年科學基金項目獲得者3人，國家“萬人計劃”科技創新領軍人才1人，國家衛生計生突出貢獻中青年專家2人。具有高級職稱醫師179人，博士生導師46名，碩士生導師55名。 醫院的眼科和耳鼻喉科均為國家重點學科及臨床重點專科。在復旦大學醫院管理研究所發布的《2019年度中國醫院專科綜合排行榜》中，醫院耳鼻喉科連續11年蟬聯榜首，眼科最新排名第二。醫院為國家藥物臨床試驗機構和醫療器械臨床試驗機構，擁有國家衛健委聽覺醫學重點實驗室、國家衛健委近視眼重點實驗室、上海市視覺損害與重建重點實驗室，是上海市耳鼻咽喉疾病臨床醫學研究中心、上海市聽覺醫學臨床中心、上海市眼部疾病臨床醫學中心、上海市眼科臨床質量控制中心、上海市眼視光學研究中心，是國家級和上海市住院醫師規范化培訓基地，是上海市眼科、耳鼻喉科、麻醉科專科醫師規范化培訓基地。2016年，醫院成立眼科、耳鼻喉科兩個研究院，整合資源，打造科研基礎平臺，實現臨床科研一體化。2019年，成立臨床研究和成果轉化中心，加快推動臨床研究，不斷促進成果轉化。 醫院承擔的各級科研項目逐年增加，其中包括國家重點基礎研究（973）項目、國家重大研發計劃等。曾獲得多項國家發明二等獎和國家科學技術進步二等獎，在國際頂級雜志《Nature》系列發表學術論文多篇。 2020年，醫院榮獲“全國文明單位”稱號，建院以來共獲8屆“上海市文明單位”稱號。面向“十四五”，五官科人將秉承“精誠、團結、求實、創新”的院訓，為把醫院建設成為“具有國際影響力，世界一流大學的一流眼耳鼻喉專科醫院和五官疾病亞洲醫學中心”而不懈奮斗。

在心血管疾病救治、未分化疾病（不明原因疾病）診斷、慢性病的健康管理等領域有豐富的臨床經驗。